1、知識產權問題。

早的有關磷酸鐵鋰離子專利申請在1993年六月二十五日由FXMITTERMAIERSOEHNEOHG(DE)獲得，并于同年八月十九日公布申請結果。磷酸鐵鋰離子的基礎專利被德州大學所有，而碳包覆專利被加拿大人所申請。這兩個基礎性專利是無法繞過去的，假如成本中計算上專利使用費的話，那產品成本將會進一步提高。

2、產品一致性差。

目前國內還沒有一家磷酸鐵鋰離子材料廠能夠解決這一問題。從材料制備角度來說，磷酸鐵鋰離子的合成反應是一個復雜的多相反應，有固相磷酸鹽、鐵的氧化物以及鋰離子鹽，外加碳的前驅體以及還原性氣相。在這一復雜的反應過程中，很難保證反應的一致性。

3、材料的制備成本與電池的制造成本較高，電池成品率低，一致性差。

磷酸鐵鋰離子的納米化和碳包覆盡管提高了材料的電化學性能，但是也帶來了其它問題，如能量密度的降低、合成成本的提高、電極生產性能不良以及對環境要求苛刻等問題。盡管磷酸鐵鋰離子中的化學元素Li，Fe與P很豐富，成本也較低，但是制備出的磷酸鐵鋰離子產品成本并不低，即使去掉前期的研發成本，該材料的工藝成本加上較高的制備電池的成本，會使得終單位儲能電量的成本較高。

4、導電性差。

這個問題是其關鍵的問題。磷酸鐵鋰離子之所以這么晚還沒有大范圍的應用，這是一個重要的問題。但是，這個問題目前已經可以得到解決：就是添加C或其它導電劑。實驗室報道可以達到160mAh/g以上的比容量。我們公司加工的磷酸鐵鋰離子材料在加工過程中已經添加了導電劑，不要制作電池時添加。實際上材料應該為：LiFePO4/C，這樣一個復合材料。

5、振實密度較低。

一般只能達到1.3-1.5g/ml，低的振實密度可以說是磷酸鐵鋰離子的大缺點。這一缺點決定了它在小型電池如手機電池等沒有優點。即使它的成本低，安全性能好，穩定性好，循環次數高，但假如體積太大，也只能小量的取代鈷酸鋰離子。這一缺點在動力鋰離子電池方面不會突出。因此，磷酸鐵鋰離子重要是用來制作動力鋰離子電池。